Kristalografi se udružuju u borbi protiv koronavirusa

The IUCr web stranica ističe brojna ključna otkrića i pruža linkove na besplatno dostupne resurse za istraživanje koronavirusa i COVID-19. U nastavku ističemo neke od napretka koje je profilirao IUCr:

na Univerzitet Teksas (UT) u Sjedinjenim Državama, Jason McLellan koristio je najmoderniju tehnologiju poznatu kao kriogena elektronska mikroskopija (cryo-EM) kako bi odredio strukturu proteina korona virusa. Cryo-EM omogućava istraživačima da naprave 3D modele ćelijskih struktura, molekula i virusa u atomskoj skali. Nakon što su kineski naučnici objavili sekvencu novog koronavirusa, dr. McLellan i njegov tim su konstruirali varijantu šiljastog proteina kako bi povećali njegovu stabilnost i ekspresiju za proučavanje, i naredili da se nukleinska kiselina sintetizira za modificirani protein šiljaka. Unutar 25 dana od primanja konstruisane nukleinske kiseline, klonirali su gen, eksprimirali protein, izolovali ga, koristili univerzitetsko cryo-EM postrojenje da odrede strukturu i predali svoj rad nauka, gdje je već bio objavljen.

Struktura šiljastog proteina 2019-nCoV u prefuzijskoj konformaciji

Ovo je 3D mapa atomske skale, ili molekularna struktura, 2019-nCoV spikeproteina. Protein poprima dva različita oblika, koja se nazivaju konformacije - jedan prije nego što inficira ćeliju domaćina, a drugi tokom infekcije. Ova struktura predstavlja protein prije nego što inficira ćeliju, nazvana prefuzijska konformacija (slika ljubaznošću Univerziteta Teksas u Austinu).

Neposredni bivši predsjednik IUCr-a, Marvin Hackert, koristio je koordinate dr. McLellana za proizvodnju 3D štampanog modela, koji je dr. McLellan pokazao na Fox National News-u u SAD-u i na WXYZ-TV Detroit.

U međuvremenu, nedavno Zajednički poljsko-njemački kristalografski sastanak u Wroclawu, u Poljskoj, započeo je plenarnim predavanjem Rolfa Hilgenfelda (Univerzitet u Lübecku, Njemačka) pod naslovom „Od SARS-a do MERS-a i virusa pneumonije u Wuhanu 2020. – Kako rendgenska kristalografija može pomoći u borbi protiv virusa u nastajanju.” Predstavljeni su rezultati koji su dobijeni tek tog dana. Više o ovim pričama možete saznati u narednom broju časopisa IUCr Newsletter, a brojni dodatni resursi su dostupni na IUCr web stranica, koji se redovno ažurira.

Virtuelno izdanje koje sadrži sve članke i sažetke o koronavirusima objavljeno u časopisima IUCr dostupno je u kolekciji koja se može besplatno čitati OVDJE. 

Fotografija: Novi korona virus SARS-CoV-2 (NIAID preko Flickr-a)